2017人工智能与生物医学大数据交叉研讨会成功举办

2017年12月2日-3日,复旦大学“人工智能与生物医学大数据”交叉研讨会暨2017年上海市生物信息学会年会在复旦大学邯郸校区成功召开,现场座无虚席,可谓人工智能与生物医学大数据领域一场学术盛宴。

 

本次研讨会由上海市生物信息学会(国内最早的生物信息学学术组织)、复旦大学类脑智能科学与技术研究院和上海市现代应用数学重点实验室联合主办,ACM SIGBIO China、中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会和中国计算机学会生物信息学专业组等协办,得到了中科曙光和Quantitative Biology的赞助。

会议邀请了美国科学院院士Michael Waterman、陈润生院士、李亦学研究员、张学工教授、胡斌教授和沈红斌等国内外人工智能与生物医学挖掘领域的著名专家,吸引了清华大学、北京大学和上海交通大学等50余家科研院校,华为技术有限公司、辉瑞医药、药明明码和上海复星医药等40余家企业单位,以及瑞金医院、仁济医院和长海医院等20多家医院,共计300余名代表参会。

会上陈润生院士等专家就人工智能与生物医学大数据交叉以及智慧医疗等方面的科研进展以及国家生物医学大数据基础设施建设等与现场听众展开深入讨论,大会对上海市生物信息学会继往工作作了总结并对时下科研热点及未来发展做出规划及展望。

承办单位复旦大学类脑智能科学与技术研究院目前已经形成了以诺奖获得者Michael Levitt和美国科学院院士Michael Waterman为核心的生物信息学和系统生物学研究团队,以期未来在脑疾病智能诊断和脑机制理解方面取得突破。


媒体视角 | 第一财经头版: 拥抱中国发展浪潮,复旦“聚宝”力邀诺贝尔奖得主加盟

11月20日,第一财经日报头版刊发了题为《拥抱中国发展浪潮,复旦“聚宝”力邀诺贝尔奖得主加盟》的文章,重点报道了复旦大学类脑智能科学与技术研究院国际化交叉创新团队的建设成效,文字转载如下:

复旦大学正在考虑邀请更多外籍诺贝尔奖得主加盟,更大程度参与上海科创中心的建设。

本月初,复旦大学校长、中科院院士许宁生教授为2013年诺贝尔化学奖得主迈克尔·莱维特(Michael Levitt)教授颁发了复旦大学名誉教授证书。

“过去20年,中国经济发生了天翻地覆的变化,未来20年,科学和技术很自然地成为了推动中国向下一个阶段发展的重要力量。”在接受第一财经记者的专访时,莱维特表示,“我希望亲身参与到中国这一波的发展浪潮中去。”

复旦大学类脑智能科学与技术研究院(下称“类脑研究院”)院长冯建峰教授告诉第一财经记者:“我们正在和莱维特教授开展前沿合作方向和人才联合培养的深入研讨,希望他能尽快参与更多复旦的工作。”

希望亲身参与中国发展

莱维特目前就职于斯坦福大学,担任结构生物学教授,他也是美国国家科学院院士和英国皇家学会会士。他有多学科学术背景,从小喜欢数学,拥有物理学与计算生物学学历,以及教授化学、物理学与生物学分子结构课程经历。2013年,因在“发展复杂化学体系多尺度模型”上所作出的突出贡献,他与马丁·卡普鲁斯( (Martin Karplus)、亚利耶·瓦谢尔(Arieh Warshel)三人共同获得了诺贝尔化学奖。

11月3日,复旦大学为莱维特举行了简单而隆重的受聘仪式。

诺贝尔化学奖获得者迈克尔·莱维特受聘复旦大学名誉教授

许宁生早在几年前就已在斯坦福大学与莱维特有过交集。冯建峰与莱维特也同为权威学术期刊《Annual Review on Biomedical Data Science》的编委。冯建峰告诉第一财经记者,他多年的好友、“生物信息学之父”迈克尔·沃特曼(Michael Waterman)曾向他透露莱维特有兴趣在中国工作,这也成为复旦大学加深与莱维特合作的重要原因。

沃特曼同时也是2015年丹·大卫奖获得者、计算生物学之父。早在2009年,沃特曼就已作为复旦大学特聘教授加盟冯建峰领衔的计算生物学研究团队,目前也是复旦大学类脑研究院的国际咨询委员会的专家,每年都会到复旦工作几个月,参与学生暑期班授课和青年人才科研课题的指导。

迈克尔·沃特曼(左一)与复旦类脑研究院团队

“莱维特教授在复旦会得到非常强大的科研方面的支持。”冯建峰对第一财经记者表示。

尽管很多外籍教授来到中国,都非常看重中国院校给到他们的科研资源,不过,对于诺贝尔奖获得者莱维特来说,大型实验室并不是他最大的兴趣所在。

“对于很多科学家而言,他们来到中国,是希望得到学术上的重视、拥有很大的实验室,但对我来说有所不同。我希望亲身参与到中国这一波的发展浪潮中去,况且我认为培养本土人才对中国来说更加重要,虽然国际交流同样不可或缺。”他说。

从上个世纪70年代起,莱维特与计算机视觉创始人之一大卫·马尔(David Marr)教授一起,就脑科学理论模型的构建开始合作研究。1977年至1979年期间,他和DNA双螺旋的发现者之一弗朗西斯·克里克(Francis Crick)教授一直致力于脑科学领域的研究和发现。莱维特对第一财经记者表示,此次访问复旦大学,他与复旦类脑研究团队就多尺度脑模型构建以及多尺度数据分析共同开展了深入的研讨,期待未来在这一领域有新的重要突破。

莱维特近几年一直活跃在中国的各大高等院校,曾先后在北大、清华、浙大、西北大学、上海科技大学等进行主题为“基础科学对于重大根本的发现是否必不可少”的演讲。站在讲台上的莱维特身穿浅棕色的西装,一条亮红色的领带格外醒目。他用幽默风趣的语言回顾了20世纪生物医学领域的重大发现,并用精妙的结构生物过程动画模型展现了过去的一个世纪中,计算机技术在生物化学模型制作中发挥的重要作用。

莱维特非常注重统计学在科研中的应用,他用各类直观易懂的统计图展示了美国基础科学家所处的科研环境以及为科学领域做出的贡献,并强调了基础科研仍然很重要的观点。

“如何赢得多个诺贝尔奖”

有意思的是,莱维特教授通过对多年诺贝尔奖的分析统计之后,总结出了“如何赢得多个诺贝尔奖”的结论。

他以英国医学研究理事会(MRC)、剑桥大学和美国的洛克菲勒大学为例,展示了基础科研圣地的成功条件,并表示他看好5人以下小团队展开的科学研究,“最容易获得诺奖”;同时需要每年约160万美元(约合1060万元人民币)的资金支持,并且要配备先进的设备和计算能力,以及充足的资源供给。

莱维特还表示,越是竞争激烈的领域越是容易获得诺贝尔奖,要像尊重诺贝尔奖得主那样去尊重学生,这样才能诞生出好的科研结果。

莱维特说,中国的科研人才现在遍布全世界,以他在斯坦福大学的团队为例,就有五六个中国学生。“他们就像我的亲人,我可以说我有好多中国的小孩。”莱维特对第一财经记者表示。

莱维特在复旦类脑研究院脑·智前沿交叉论坛发表演讲

根据他列出的统计数据,全球范围内对于年轻科学家的资助正在减少,也意味着越来越难获得资金支持,这是导致美国等地从事基础科研的年轻人减少的关键因素。他认为,这是一个全球值得引起重视的现象,科研资金应该合理地向年轻人倾斜,以鼓励更多年轻人参与基础科研。

他给年轻科学家提出的忠告包括:做自己喜欢做的事情,要充满激情、更要持之以恒,要有独特的想法以及有一颗善良的心,当然还要有质疑的精神。

学术大咖们的中国缘

复旦大学近年来在外籍专家引进方面做了很大的努力。

就在上个月,2009年诺贝尔化学奖得主、全球著名的生物化学和结构生物学家、美国耶鲁大学教授、霍华德·休斯医学研究所研究员托马斯·施泰茨(Thomas A. Steitz)访问复旦大学,并受聘为复旦大学名誉教授。复旦大学将和施泰茨在核糖体相关研究以及新型抗生素的研发方面进行战略合作,建立核糖体晶体和冷冻电镜结构生物学研究平台、新型抗生素研制开发平台。

复旦大学计算系统生物学中心特聘教授大卫·韦克斯曼(David Waxman),于2011年7月辞掉在英国苏塞克斯大学的教职,同妻子玛瑞来到复旦大学担任全职教授。韦克斯曼主要从事定量生物学领域研究;玛瑞则是复旦大学环境科学与工程系特聘教授,同时担任英国布莱顿大学可持续发展统筹中心主任,主要研究可持续发展应用项目。他们都是国家“外专千人计划”专家。

韦克斯曼夫妇

大卫·韦克斯曼及妻子玛瑞·哈德

韦克斯曼来到复旦缘于一次偶然。多年前,他结识了到英国讲学的时任复旦大学计算系统生物学中心主任冯建峰,两人对跨学科教育都有独特见解,相见恨晚,结下了深厚情谊。在冯建峰的邀请下,自2009年起,韦克斯曼以复旦大学客座教授的身份多次访问中国。

“在全职到复旦工作以前,其实我已经来过中国几次,所以对我来说,这里并不是一个陌生的地方。我对中国一直很感兴趣,中国发展变化之快给我的每一次经历都带来了新的感触。”在回忆起自己的经历时,韦克斯曼说,“当机会来了,而我没有去珍惜的话,若干年后我肯定会非常后悔,这几年工作下来,我非常喜欢复旦和这里的中国同事,我相信,这里国际化的视野和前沿的科研合作能力会吸引越来越多的国际团队加盟。”

大卫·韦克斯曼指导学生做课题

大卫·韦克斯曼指导学生做课题

2015年3月,复旦大学专门成立了类脑研究院,希望整合现有的国际化团队力量,围绕脑与类脑研究前沿优势领域,真正建成可以参与和引领国际合作的一流新型研究机构。

该研究院下设从认知神经科学到计算生物学、生物医学大数据、神经智能工程等多个交叉研究中心。在短短两年多时间,就引进了二十多名优秀的中青年科研骨干,并成立了一支由15名国际顶尖专家组成的国际咨询委员会,其中包括多名积极活跃在美国、欧洲的计算和神经科学领域的学术大师。

今年,英国神经科学学会前主席、剑桥大学心理系原主任特雷弗·罗宾斯(Trevor Robbins)教授也受聘复旦大学名誉教授。罗宾斯在2014年荣膺“格雷特·伦德贝克欧洲大脑研究奖”——这一奖项有神经科学界的诺奖之称。在罗宾斯卸任剑桥心理系主任的晚宴上,他同时向他剑桥的同事们宣布了加盟复旦的消息。目前,罗宾斯已在与复旦团队讨论在张江成立认知神经科学研究所,并推进脑与类脑研究计划。

特雷弗·罗宾斯受聘复旦大学名誉教授

复旦大学类脑研究院教授、神经与智能工程中心主任王守岩曾在英国牛津大学从事博士后工作,后在英国南安普顿大学担任讲师,2012年回国在中科院苏州生物医学工程技术研究所任职,今年年初加入复旦大学类脑研究院。

王守岩对第一财经记者表示:“加入复旦主要是因为希望能够培养更多的学生,并在人工智能科学前沿做一些探索性工作。”王守岩教授目前从事的是智能脑刺激调控领域的研究,简而言之,就是研究如果大脑发生了异常,人们是否可以给它重新“编程”让它恢复到正常状态,这一研究将为帕金森病、老年痴呆等的治疗提供创新的技术。

复旦大学此次有意和莱维特教授开展更为全面的合作,也获得了业内的高度关注。

上海市科学学研究所创新政策研究室副主任、副研究员常静对第一财经记者表示:“之前一直听说复旦要引进他,学校对莱维特很重视。因为莱维特的领域与复旦已有的科研优势非常融合,希望通过科研攻关,能催生新的成果。”

 


脑·智前沿交叉论坛特邀嘉宾 Michael Levitt 受聘复旦大学名誉教授

11月3日,第六届脑·智前沿交叉论坛暨诺奖得主 Michael Levitt 受聘复旦大学名誉教授仪式在光华楼十三楼多功能厅举行。中科院院士、复旦大学校长许宁生教授出席了授证仪式,为 Levitt 教授颁发复旦大学名誉教授证书并合影留念。仪式由复旦大学类脑智能科学与技术研究院院长冯建峰教授主持。

授证仪式后,Levitt 教授在第六期脑·智前沿交叉论坛上以 “Is Basic Science Essential for Significant and Fundamental Discoveries?” 为题为在场的复旦师生作了精彩的学术报告,并就一些科学及年轻人科研启航相关的问题作了细致的解答。千人计划专家 David Waxman 听完报告很有感触地说,Levitt 教授学养深厚,视野开阔,这是他听过的最好的讲座。

Levitt 教授表示,他从70年代开始就和计算机视觉创始人之一David Marr 教授就脑科学理论模型构建开始合作研究,1977年至1979年近两年的时间里,他和双螺旋的发现者 Francis Crick 教授一直致力于脑科学的发现。此次访问复旦大学,他将与复旦团队共同就多尺度脑模型构建以及多尺度数据分析开展深入的研讨,期待未来在这一领域有新的重要突破。

Levitt 教授目前就职于斯坦福大学,也是美国国家科学院院士和英国皇家学会会士。他有多学科学术背景,从小喜欢数学,拥有物理学与计算机生物学学历,以及教授化学、物理学与生物学分子结构课程经历。他和 Martin Karplus、Arieh Warshel 教授因在“发展复杂化学体系多尺度模型”上所作出的突出贡献,共同获得2013年诺贝尔化学奖。

当天下午,上海市市委副书记尹弘会见了 Levitt 教授。双方就上海科创中心建设、具有国际竞争力的青年才俊的培养等话题交换了意见。许宁生校长、周亚明副校长、冯建峰教授参加了会谈。Levitt 教授表达了与复旦相关研究团队开展深入合作,共同服务上海全球科技创新中心建设,“成为中国梦一部分”的美好愿望。

 


类脑研究院组织开展纵向科研项目申报沟通交流会议

2017年9月20日下午,复旦类脑研究院在逸夫楼会议室组织开展科研项目申报沟通交流会议。

会上,科技处副处长范仁华介绍了复旦大学纵向科研项目申报情况,随后科技处重大办主任杨鹏、基础办副主任王浩、基础办熊莉君老师分别介绍了重点研发计划与重大专项、国家自然科学基金、上海市科委项目的管理经验。

类脑研究院院长冯建峰教授、常务副院长林伟教授、王守岩教授、赵兴明教授、张捷研究员、王鹤、张孝勇青年研究员等分别介绍了其研究方向与成果。

 

通过本次会议,科技处和类脑研究院进行了充分的沟通交流。

此次交流会对之后的项目申报工作有着建设性指导意义,广大师生表示受益匪浅。

 


转发复旦科技处—关于转发上海市科委2017年度“科技创新行动计划”产学研医合作领域项目指南的通知

各有关单位:

现转发上海市2017年度“科技创新行动计划”产学研医合作领域项目指南,上海市科委网上申报截止时间为2017年9月21日16:30,请理工科有意申报的老师9月18日上午10:00完成网上及纸质版提交(书面材料一式两份:市科委要求提交一份,科技处留底一份)。市科委具体通知请见附件。

联系人:

熊莉君  邮箱:xlj@fudan.edu.cn      电话:65643671

王  浩  邮箱:hao.wang@fudan.edu.cn 电话:65642662

地址: 复旦大学邯郸校区第一教学楼1303室

 

 

科技处基础研究办公室

2017年8月28日

附件:

关于发布上海市2017年度“科技创新行动计划”产学研医合作领域项目指南的通知

各有关单位:

  为推进实施创新驱动发展战略,加快建设具有全球影响力的科技创新中心,根据《上海市科技创新”十三五”规划》,上海市科学技术委员会特发布2017年度“科技创新行动计划”产学研医合作领域项目指南。

  一、征集范围

  专题1、创新生物药的临床试验研究

  研究目标:完成免疫检查点抑制剂等创新药物的临床试验,申请新药证书;完成创新药物的Ⅳ期临床试验和新适应症研究;完成三类以上已上市重大品种的临床再评价研究。

  研究内容:开展PD-1、GLP-1等创新药物的Ⅲ、Ⅳ期临床试验、新适应症,以及新药大样本疗效和不良反应监测研究;开展已上市重大产品奥佑静等的临床疗效再评价研究。

  执行期限:2020年12月31日前完成。

  专题2、中药产品的深度开发研究

  研究目标:建立胆宁片整体性、科学性的质量标准体系,完成产品出口加拿大的药品境外生产场地认证(FSRN);完成芪骨胶囊上市后大样本临床再评价研究,为临床准确合理用药提供依据。

  研究内容:在诠释产品核心功效科学内涵的基础上,开展胆宁片全产业链的质量控制关键技术研究,健全完善质量标准,满足产品出口需求;开展芪骨胶囊治疗原发性骨质疏松症的多中心临床研究,明确其降低骨折风险的有效性以及长期用药的安全性。

执行期限:2020年12月31日前完成。

  专题3:创新医疗器械的临床示范应用和再评价研究

  研究目标:完成上市后医疗器械产品的临床示范应用和再评价。

  研究内容:针对已通过国家创新医疗器械特别审批程序上市的3类医疗器械产品,开展临床示范应用研究或临床再评价研究,提出改进产品质量的方案。

  执行期限:2020年12月31日前完成。

  专题4:智慧即时检测医学平台临床示范应用研究

  研究目标:建成基于互联网+小型智慧即时检测医学平台。

  研究内容:利用大数据、云技术和人工智能技术,开展互联网+小型智慧即时检测设备医学平台的临床示范应用研究,验证设备和平台临床应用的有效性和质量可靠性。

  执行期限:2020年12月31日前完成。

  专题5: 儿童X线数字影像系统的临床示范应用研究

  研究目标:完成儿童X线数字影像系统(DR)的临床示范应用研究。

  研究内容:基于国产低剂量智能平板探测器的核心技术,开展具有自主知识产权的儿童医用X线影像系统的临床应用和推广研究,根据临床示范数据分析,进一步优化系统,提升产品的性能。

  执行期限:2020年12月31日前完成。

  申报主体:本市企业牵头,联合多家医院共同申报(专题2除外)。申报单位需提交临床批件、新药证书或产品注册证,以及正式合作协议等附件材料。

  配套要求:企业投入研发经费与申请专项资助经费之比不低于2:1。

  二、申报要求

  1、项目申报单位应当是注册在本市的独立法人单位,具有组织项目实施的相应能力。

  2、已作为项目责任人承担市科委科技计划在研项目2项及以上者,不得作为项目责任人进行申报。

  3、项目责任人应承诺所提交材料真实性,不含涉密内容;申报单位应当对申请材料的真实性进行审核。

  4、项目责任人在填报可行性方案时,必须在“二、研究内容和技术关键”栏目中首先说明项目研究是否涉及人类遗传资源的国内国际合作,如涉及人类遗传资源的出境,还需说明是否已经获得中国人类遗传资源管理办公室的批准。

  三、申报者权利

  申报项目若提出回避专家申请的,须在提交项目可行性方案等书面材料的同时,由申报单位出具公函提出回避专家名单,并说明理由。每个项目申请回避专家人数不超过3人。对于理由不充分或逾期提出申请的,不予采纳。

  四、申报方式

  1、本指南公开发布。申请人通过“中国上海”门户网站(http://www.shanghai.gov.cn/)进入“上海市财政科技投入信息管理平台”,网上填报项目可行性方案,并在线打印书面材料(非由申报系统在线打印的书面材料,或书面材料与网上填报材料不一致的,不予受理)。

  2、项目网上填报起始时间为2017年9月4日9:00,截止时间为2017年9月21日16:30。市科委办事大厅集中接收书面材料时间为2017年9月18日至2017年9月22日,每个工作日9:00-16:30。逾期送达的,不予受理。所有书面材料采用A4纸双面打印,一式一份,须签字盖章齐全。使用普通纸质材料作封面,不采用胶圈、文件夹等带有突出棱边的装订方式。

  市科委办事大厅地址:徐汇区钦州路100号1号楼。

  办事大厅不接收以邮寄或快递方式送达的书面材料。

  3、网上填报备注:

  (1)登陆“中国上海”网站(http://www.shanghai.gov.cn/);

  (2)网上政务大厅—审批事项—点击“上海市财政科技投入信息管理平台”图片链接进入申报页面:

  -【账户注册】转入注册页面进行单位注册,然后再进行申报账号注册(单位注册需使用“法人一证通”进行校验);

  -【初次填写】使用申报账号登录系统,转入申报指南页面,点击相应的指南专题后开始申报项目;

  -【继续填写】登录已注册申报账号、密码后继续该项目的填报。

  (3)有关操作可参阅在线帮助。

  五、其它说明

  本指南经评审立项的项目承担单位,须在项目验收时一并提交《科技报告》和《科技报告收录证书》。

  六、咨询电话

  服务热线:8008205114(座机)、4008205114(手机)

  技术支持:62129099-2257


转发复旦科技处—转发8月份国家自然科学基金委系列项目指南等的通知

转发8月份国家自然科学基金委系列项目指南等的通知
 

各院系、各单位:

基金委8月初至今陆续发布系列项目指南和化学科学部的三项立项建议。

请有意申报的老师仔细阅读相关申报指南(尤其是申报要求、限项规定、截止时间,和国际合作项目合作协议、外方申请要求,以及所有附件要求),尽快登陆ISIS系统及时填报。请申报人务必在基金委截止日提前2的下午16:00之前网上提交,同时提前1将纸质申请书一式两份提交科技处基础办。

请有意提供立项建议的老师,务必在基金委截止日提前2的下午16:00之前提交电子版并抄送科技处,同时提前1将纸质申请书一式两份提交科技处基础办。

 

联系电话:021-65642662

联系人:邓峰 dengfeng@fudan.edu.cn

王浩 hao.wang@fudan.edu.cn

 

科技处基础办

2017年9月4日

 

1、特提斯地球动力系统重大研究计划2017年度项目指南(8月4日发布,9月15日截止)

http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/zdyjjh/info69938.htm

 

2、国家自然科学基金“基因组DNA大分子设计原则与化学再造”应急管理项目指南(8月8日发布,9月15日截止)

http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/tab452/info69991.htm

 

  1. 国家自然科学基金委员会-中国科学院空间科学卫星科学研究联合基金2017年度项目指南(8月9日发布,9月15日截止)

http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/tab452/info69994.htm

 

4、2018年度国家自然科学基金委员会与英国皇家学会合作交流项目指南(8月15日发布,10月13日截止)

http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/tab442/info70072.htm

 

  1. 国家自然科学基金委员会-中国航天科技集团公司航天先进制造技术研究联合基金2017年度项目指南(8月23日发布,9月29日截止)

http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/tab452/info70107.htm

 

6、化学科学部关于征集化学科学领域重大项目、“基础科学中心项目”、前沿导向重点项目/重点项目群立项建议的通告(8月29日发布,9月20日截止)

http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/tab442/info70184.htm

http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/tab442/info70185.htm

http://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/tab442/info70186.htm


2017年我院3项国家自科项目、7项上海市科委科研项目获批立项

近日,国家自然科学基金委员会公布了2017年国家自然科学基金集中受理期资助项目清单,我院共获资助项目3项。另外,自2017年以来我院获得上海市科委资助项目7项。

我院纪鹏青年研究员、程炜博士后各获国家自然基金青年科学基金项目1项,李春贺青年研究员获国家自然基金面上项目1项。

王守岩教授获批上海市科委科技创新行动计划1项,王鹤青年研究员获得上海市自然科学基金传统类1项,程炜博士后、马宁宁博士后、姚烨博士后各获得上海市科委杨帆计划项目1项,张捷研究员、纪鹏青年研究员各获得上海市自然基金探索类项目1项。2017年以来我院7项上海市科委科研项目获批立项。

国家自然科学基金作为我国支持基础研究的主渠道之一,面向全国,重点资助具有良好研究条件、研究实力的高等院校中和科研机构中的研究人员。二十多年来,自然科学基金在推动我国自然科学基础研究的发展,促进基础学科建设,发现、培养优秀科技人才等方面取得了巨大成绩。