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人员

  • 简要介绍：原致远，长聘副教授/研究员，博士生导师，上海市浦东医院双聘研究员，空间组学整合研究中心副主任。研究方向为基因组语言模型、AI虚拟细胞技术、生成式及可解释人工智能方法及在时空组学中的应用。本科毕业于武汉大学计算机学院，博士毕业于清华大学自动化系，之后加入复旦大学任独立PI。入选国家高层次人才特殊支持计划青年项目、周传纪念奖，上海市人才计划（青年东方英才、晨光学者、扬帆计划、明珠菁英人才、上海科技35U35）及复旦大学卓学人才计划。 学术成果以第一或通讯作者（含共同）发表在 Nature Methods（2021/2023/2024）、 Nature Machine Intelligence（2025）、 Nature Protocols（2024）、 Cell Genomics（2024）、Nature Communications（2022/2024/2025a/2025b）等期刊。部分成果被选为 Nat. Methods TOP 1% 热点论文、Nat. Methods/Nat. Commun./Cell Genom. 亮点论文。一作/通讯获中国生物信息学十大进展（2次）、世界人工智能大会青年优秀论文奖。主持国家自然科学基金面上、青年项目、上海市计算生物学重点专项、曹娥江基础创新培育项目；连续3年主持腾讯AI Lab/CCF犀牛鸟专项研究基金（2023/2024/2025），并获得年度“优秀奖”；骨干参与国家重点研发计划、上海市重点专项等重大科研任务。 担任腾飞书院及大数据学院本科生班导师。指导本科生一作发表于Nature Machine Intelligence；指导本科生获得“莙政”科研项目立项并优秀结题，其获复旦大学“莙政学者”奖励；指导研究生一作发表于Nature Methods、Nature Protocols、Cell Genomics、Nature Communications等期刊。担任 Genom. Proteom. Bioinf.（GPB）、J. Genet. Genom.（JGG）青年编委。担任方法学（Nat. Methods/Nat. Biotechnol./Nat. Mach. Intell./Nat. Comput. Sci.），生物学（Nat. Metab., Nat. Struct. Mol. Biol., Cell Genom., Cell Syst.）及综合性（Nat. Commun., Science Advances, Natl Sci Rev, Cell Rep.）等30余种权威期刊审稿人。中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员、中国计算机学会生物信息专委会委员、中国生物信息学会(筹)生物信息学算法研究专委会委员、上海市生物信息学会委员。招生要求见课题组主页：https://yuanstlab.github.io/
  • 代表成果：

    1. [Nature Methods 2025] https://doi.org/10.1038/s41592-025-02926-6

    Y Liu*, C Wang* ... R Guan#, Z Yuan#

    2. [Nature Methods 2025] https://doi.org/10.1038/s41592-025-02969-9

    S Lin*, Z Wang* ... Y Zhao#, Z Yuan#

    3. [Nature Methods 2024] https://doi.org/10.1038/s41592-024-02215-8

    Z Yuan*#, F Zhao* ... XY Zhang, Y Zhao#

    4. [Nature Methods 2023] https://doi.org/10.1038/s41592-023-01773-7

    Z Yuan*#, W Pan* ... MQ Zhang#, J Yao#

    5. [Nature Methods 2021] https://doi.org/10.1038/s41592-021-01276-3

    Z Yuan*, Q Zhou* ... X Zhang#, MQ Zhang#

    6. [Nature Machine Intelligence 2025] https://doi.org/10.1038/s42256-025-01097-5

    C Han*, S Lin* ... Q Zou, Z Yuan#

    7. [Nature Protocols 2024] https://doi.org/10.1038/s41596-023-00925-5

    S Lin*, F Zhao ... Y Zhao#, Z Yuan#

    8. [Nature Communications 2025] https://doi.org/10.1038/s41467-025-61476-9

    Y Cui*, Z Yuan#

    9. [Nature Communications 2025] https://doi.org/10.1038/s41467-025-58079-9

    S Fang*, M Xu* ... Z Yuan* ... Y Li#, X Xu#

    10. [Nature Communications 2024] https://doi.org/10.1038/s41467-023-44367-9

    Z Yuan*#

    11. [Nature Communications 2022] https://doi.org/10.1038/s41467-022-34867-5

    Z Yuan*#, Y Li* ... J Yao#, MQ Zhang#

    12. [The Innovation 2025] https://doi.org/10.1016/j.xinn.2025.101220

    H Shu*, J Chen* ... Z Yuan#, T Wang#

    13. [Cell Genomics 2024] https://doi.org/10.1016/j.xgen.2024.100565

    S Lin*, Y Cui ... Y Zhao#, Z Yuan#

    14. [Genome Biology 2025] https://doi.org/10.1186/s13059-025-03796-z

    K Dong*, Y Gao* ... Z Yuan#, Q Liu#

    15. [Genome Biology 2023] https://doi.org/10.1186/s13059-023-03078-6

    T Guo*, Z Yuan* ... MQ Zhang#, X Li#


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  • 复旦大学类脑智能科学与技术研究院,复旦大学类脑研究院