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人员

  • 简要介绍:原致远,长聘副教授/研究员,博士生导师,国家级青年人才,空间组学整合研究中心副主任。研究方向为计算空间组学、生命科学基础模型、AI虚拟器官重构。本科毕业于武汉大学计算机学院,博士毕业于清华大学自动化系,之后加入复旦大学任独立PI。学术成果以第一或通讯作者(含共同)发表在 Nature Methods x6、Nature Machine Intelligence、Nature Computational Science、Nature Protocols、Cell Genomics、Nature Communications x4等期刊。获中国生物信息学十大进展(2次)、世界人工智能大会青年优秀论文奖。 主持国家自然科学基金面上、青年项目、上海市计算生物学重点专项、曹娥江基础创新培育项目;连续3年主持腾讯AI Lab/CCF犀牛鸟专项研究基金(2023/2024/2025),并获得年度“优秀奖”;骨干参与国家重点研发计划、上海市重点专项等重大科研任务。担任腾飞书院及大数据学院本科生班导师。指导本科生一作发表于Nature Machine Intelligence,并获得国自然本科生项目、复芏计划等资助;指导研究生一作发表于Nature Methods、Nature Computational Science、Nature Protocols、Cell Genomics、Nature Communications等期刊。团队成员获得博士生青托、本/博国家奖学金、䇹政学者、智擎学者等荣誉。 担任 Genome Biology编委、National Science Review学科编辑、 Genom. Proteom. Bioinf.(GPB)、J. Genet. Genom.(JGG)青年编委。担任综合性(Nature, Cell, Nat. Commun., Science Advances, Natl Sci Rev, Cell Rep.),方法学(Nat. Methods, Nat. Biotechnol., Nat. Biomed. Eng., Nat. Mach. Intell., Nat. Comput. Sci.),生物学(Nat. Genet., Nat Cell Biol., Nat. Metab., Nat. Struct. Mol. Biol., Cell Genom., Cell Syst.)等40余种高影响力期刊审稿人。担任国际计算生物学学会中国理事会理事、中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员、中国计算机学会生物信息专委会委员、中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会委员、中国生物信息学会(筹)生物信息学算法研究专委会委员、上海市生物信息学会委员。 招生要求见课题组主页:https://ystlab.github.io/YuanSTLab/
  • 代表成果:

    1. [Nature Methods 2026] https://doi.org/10.1038/s41592-026-03034-9

    B Dai*, L Yi* ... Z Yuan#, Y Zuo#


    2. [Nature Methods 2025] https://doi.org/10.1038/s41592-025-02926-6

    Y Liu*, C Wang* ... R Guan#, Z Yuan#


    3. [Nature Methods 2025] https://doi.org/10.1038/s41592-025-02969-9

    S Lin*, Z Wang* ... Y Zhao#, Z Yuan#


    4. [Nature Methods 2024] https://doi.org/10.1038/s41592-024-02215-8

    Z Yuan*#, F Zhao* ... XY Zhang, Y Zhao#


    5. [Nature Methods 2023] https://doi.org/10.1038/s41592-023-01773-7

    Z Yuan*#, W Pan* ... MQ Zhang#, J Yao#


    6. [Nature Methods 2021] https://doi.org/10.1038/s41592-021-01276-3

    Z Yuan*, Q Zhou* ... X Zhang#, MQ Zhang#


    7. [Nature Machine Intelligence 2025] https://doi.org/10.1038/s42256-025-01097-5

    C Han*, S Lin* ... Q Zou, Z Yuan#


    8. [Nature Computational Science 2026] https://doi.org/10.1038/s43588-026-00977-z

    Y Yan*, T Gu, … Z Yuan#, BZ Qian#


    9. [Nature Protocols 2024] https://doi.org/10.1038/s41596-023-00925-5

    S Lin*, F Zhao ... Y Zhao#, Z Yuan#


    10. [Nature Communications 2025] https://doi.org/10.1038/s41467-025-61476-9

    Y Cui*, Z Yuan#


    11. [Nature Communications 2025] https://doi.org/10.1038/s41467-025-58079-9

    S Fang*, M Xu* ... Z Yuan* ... Y Li#, X Xu#


    12. [Nature Communications 2024] https://doi.org/10.1038/s41467-023-44367-9

    Z Yuan*#


    13. [Nature Communications 2022] https://doi.org/10.1038/s41467-022-34867-5

    Z Yuan*#, Y Li* ... J Yao#, MQ Zhang#


    14. [The Innovation 2025] https://doi.org/10.1016/j.xinn.2025.101220

    H Shu*, J Chen* ... Z Yuan#, T Wang#


    15. [Cell Genomics 2024] https://doi.org/10.1016/j.xgen.2024.100565

    S Lin*, Y Cui ... Y Zhao#, Z Yuan#